이번 감염소-역학 조사의 지표가 된 동물-는 텍사스의 농장(역학 조사의 지표 농장)에서 태어나고 자랐다. 해당 소는 크림색을 띤 브라마(Brahma) 교잡종으로 사망 당시 나이가 12살 가량이었다. 또한 이 소는 식품의약국(FDA)이 1997년 사료금지법을 시행하기 이전에 태어났다. 이 소는 2004년 11월에 가축 시장을 통해 판매되어 도축 가공장으로 이동되었으며 도착 당시 이미 사망상태였고, 이후 애완동물 사료 공장으로 옮겨져 거기에서 BSE 검사를 위한 샘플이 채취 되었다. 해당 애완동물 사료 공장은 이 동물을 사료 원료로 사용하지 않았으며, 동식물검역소(APHIS)는 1990년 이후 이 해당 지표 농장을 떠난 모든 성우(adult animals) 에 대한 추적 작업을 시행하였다. 또한 ‘‘관심 동물(animals of interest)'로 분류된 해당 소의 사망 당시로부터 2년 이내에 태어난 자손들에 대한 추적 작업도 이루어졌다.

이번 역학 조사 동안, 미농무부는 이번 감염소가 속해 있던 최초 농장의 우군에서 총 67마리의 관심대상소(animals of interest)를 제거 및 검사하였다. BSE 검사가 실시된 총 67마리의 소 모두 음성으로 판명되었으며, 해당 지표 농장의 성우 총 200마리는 모두 이 농장을 떠난 것으로 밝혀졌다. 동식물검역소(APHIS)의 관계자들에 따르면, 총 200마리의 성우 중 143마리는 도축장으로 이동되었음이 확인되었고, 2마리는 생존해 있으며(그 중 한마리는 나이가 어리고 다른 BSE 검사에서 음성 판정을 받아 ‘‘관심동물’’로 분류되지 않았다), 34마리는 사망한 것으로 추정되었으며, 1마리는 사망한 것으로 확인되었고, 나머지 20마리는 추적이 불가능한 것으로 밝혀졌다. 해당 농장의 성우 이외에, 동식물검역소(APHIS)는 해당 감염소에서 태어난 2마리의 송아지를 찾아내는 작업도 실시하였다. 기록 보존 및 식별문제 등의 이유로, 동식물검역소(APHIS)는 총 213마리의 송아지에 대한 추적 작업을 실시해야 했으며 총 213마리의 송아지 중, 208마리는 사료 공장이나 도축장으로 유입되었음이 확인되었고, 4마리는 사료 공장이나 도축장으로 유입된 것으로 추정되었고, 나머지 1마리는 추적이 불가능한 것으로 밝혀졌다.

오염된 사료가 해당 지표 동물의 감염에 어떠한 역할을 했는지 파악하기 위해 식품의약국(FDA)과 텍사스 사료 및 비료 관리소는 다음의 두 가지 목적 하에 사료 조사를 실시하였다. ; 1) 감염소에 급여된 사료에 사용된 모든 단백질 원에 대한 이력을 파악함으로써 그것이 BSE 인자의 원인이었는지를 확인, 2) 1997년 이후 원산지 집단에서 벗어난 소가 미농무부에서 문제의 동물로 확인된 것인지 또 이 소가 1997년 BSE/반추동물 사료금지법을 준수하여 렌더링 되었는지를 검증.

사료의 이력 조사는 1990년 이후부터 이 농장에서 사용된 21종의 사료 또는 사료첨가물에 대해 실시되었다. 사료 원료는 사료 소매 판매점에서 구입되었으며 9개의 사료공장에서 생산되었음이 확인되었다. 또한 1997년 이래로 금지된 포유류 단백질을 포함한 사료나 사료 첨가물이 사용되지 않았음을 확인하였다. 이에 식품의약국(FDA)은 이 소가 1997년 BSE/반추동물 사료금지법 시행 이전에 BSE에 감염되었을 가능성이 크다는 결론을 내렸다.

또한 이번 조사에서는 9개의 도축장과 8개의 렌더링 공장에 대한 방문조사를 통해 감염소의 원산지 집단의 다른 소들의 처리에 대해서도 이루어졌다. 조사결과 모든 렌더링 공장은 BSE/반추동물 사료금지법을 준수하여 운영되었음이 밝혀졌다. 이번에 관련된 모든 렌더링 공장의 이력 조사를 통해 식품의약국(FDA)의 사료금지법 위반 사항이 전혀 없었음이 밝혀졌다.

동식물검역소(APHIS)와 식품의약국(FDA)은 이번 조사결과 이번 감염소가 다른 가축에 전혀 위험성이 없었으며 또한 반추동물 사료금지법 또한 준수되었다는 점에 대해 매우 기쁘게 생각한다. 미국은 다각적인 방화벽을 통한 BSE 방어 시스템을 유지함으로써 사람의 식품 공급망과 동물의 사료 공급망으로 BSE인자가 유입되는 것을 효과적으로 방지하고있다. 미농무부는 미국내에서 BSE를 찾아내는 노력을 계속 할 것이다. 지금까지 미국은 지난 14개월간 45만두 이상의 소에 대한 검사를 실시하였으며 이중 단 두건의 BSE 양성 동물이 발견되었다.

해당소는 미국 앨라바마(Alabama)주에서 자란 산타 거트루디스(Santa Gertrudis)종 암소로, 보행이 불가능했으며 농장에서 즉시 살처분 되어 식품 공급망에는 유입되지 않았다. 또한 치아감별법에 의해, 해당소의 나이는 10살이 넘은 것으로 추정되며 따라서 미농무부가 반추류동물에 반추류동물의 단백질을 사료로 사용하는 것을 금지하기 시작한 1997년 이전에 태어난 것으로 추정된다.

미농무부는 해당 우군의 원산지와, 해당소의 자손을 비롯해 해당 소가 출생한 이후 1년 이내에 태어난 동거 소들에 대한 조사작업을 실시할 예정이다. 해당 소는 살처분 된 농장에서 1년 미만 동안만 사육되어왔다.

이번에 미국에서 발견된 BSE는 미농무부의 농업연구청(ARS)에서 실시한 웨스턴블롯(Western Blot) 과 또 한 번의 속성 테스트에서 확인 된 것이다. 현재 정밀 검사인 면역조직화학(IHC) 검사가 진행 중에 있으며 이에 대한 결과는 4~5일 후에 나올 것으로 예상된다.

미농무부는 앨라바마주정부의 관련담당자들과의 협력아래 해당 소의 원산지 등에 대한 추가 정보 수집을 위해 해당 우군에 대한 역학조사 작업을 실시 중에 있다.

해당소의 자손을 비롯해 해당 소가 출생한 이후 1년 이내에 태어난 동거 소들에 대한 조사작업도 실시할 예정이며 미국식품의약국(FDA)의 관련 담당자들과 함께 이번 역학조사와 연관된 사료기록에 대해서도 조사할 예정이다.

앞서 2006년 3월 13일, 미농무부는 앨라바마 주에서 자란 암소를 대상으로 정밀 검사를 실시한 결과 웨스턴블롯(Western Blot) 검사에서 BSE 양성 결과가 나왔다고 밝힌 바 있다. 웨스턴 블롯(Western Blot) 검사와 동시에 미국 아이오와주 에임즈에 위치한 미국 동식물검역소(APHIS) 국립수의과학연구소(NVSL)에서 면역조직화학(IHC)검사를 실시하였으며 2006년 3월 15일 양성 결과가 나왔다. 미국 동식물검역소(APHIS)의 규정에 따라, 웨스턴블롯과 면역조직화학 검사 중 어느 한가지 검사에서만이라도 양성 결과가 나올 경우 그 동물은 BSE에 감염된 것으로 간주한다.

발굴된 지육의 샘플은 다시 아이오와주 에임즈에 있는 미농무부 국립수의과학연구소(NVSL) 연구소로 이송되어 BSE 양성 반응을 보인 샘플과의 DNA 대조 작업이 실시되었다. 한편, 해당 DNA는 이후 역학조사가 이루어지는 동안 발견되는 해당 BSE 감염소의 의심되는 형제 및 자손과의 DNA 대조 작업에도 사용될 예정이다.

해당 소를 대상으로 전문가들은 치아감별법을 통한 추가적인 조사 작업을 시행하였고, 그 결과 해당소의 나이는 최소한 10살이라는 것이 확인되었다. 이는 해당소가 미국식품의약국(FDA)에서 사료금지법을 시행하기 시작한 1997년 이전에 태어났다는 것을 의미하는 것이다.

이번에 발굴된 해당 소의 지육 이외에, 미농무부 관련담당자들은 해당 BSE 감염소가 낳은 생후 6주의 송아지를 찾아냈으며, 그에 대한 검역을 완료하였고 추가조사를 위해 미농무부 국립수의과학연구소(NVSL)로 곧 이송되었다.